要保人投保本保險時，應委任保險人代為向主管機關申請保險費補助；其補助作業程序如下：
一、保險人應於承保次月十五日前，將申請案登入乳牛死亡保險資訊管理系統彙整造冊，送主管機關申請補助。
二、經審核符合規定者，主管機關應於清冊送達次日起三個月內，核撥補助款予財團法人農業保險基金（以下簡稱農險基金），以充抵保險費。
要保人投保本保險經核保後，主管機關得依第五條附表補助其保險費，並編列預算補助之。