種苗檢驗科掌理事項如下：
一、種子品質檢查業務之執行。
二、種苗病原檢測技術之研發及應用。
三、種子純度與特定性狀分子檢定技術之研究及開發。
四、基因轉殖植物種苗檢測技術之研發及執行。
五、種苗檢測技術之合作及推廣。
六、其他有關種苗檢驗研究事項。