研究發展科掌理事項如下：
一、花卉品種改良之種原蒐集、保存、利用、雜交選育及命名推廣。
二、花卉穩質穩量、智慧環控、低碳節能永續生產之技術研發及驗證。
三、花卉採後處理與冷鏈運輸等產銷供應鏈上下游之技術研發及驗證。
四、花卉基礎研究發展之規劃及執行。
五、其他有關花卉研究發展事項。