本院設下列部、中心、科、室：
一、內科部，分十一科辦事。
二、外科部，分九科辦事。
三、婦女醫學部，分三科辦事。
四、兒童醫學部，分三科辦事。
五、急診部，分三科辦事。
六、重症醫學部，分二科辦事。
七、放射線部，分四科辦事。
八、護理部。
九、教學研究部，分二科辦事。
十、醫務企管部，分三組辦事。
十一、綜合醫學中心，分十三科辦事。
十二、高齡醫學中心，分二科辦事。
十三、癌症防治科。
十四、藥劑科。
十五、營養科。
十六、感染管制室。
十七、社會工作室。
十八、職業安全衛生室。
十九、工務室。
二十、補給室。
二十一、總務室。
二十二、人事室。
二十三、政風室。
二十四、主計室。
二十五、資訊室。
本院龍泉分院之業務，由本院人員派充辦理。