執行單位應將研發成果之收入及支出單獨設帳管理，定期編製收支報表，送本會或所屬機關（構）備查，並於會計制度內增訂有關研發成果之會計事務處理事項。
執行單位應於內部稽核制度內增訂有關研發成果之稽核項目及程序，並確實執行稽核業務。