系統發展室掌理事項如下：
一、飛航管理系統之發展、規劃及建置。
二、飛航管理系統與其備援系統功能之提升、測試協調作業、轉移、審核及建議。
三、塔臺自動化系統之發展、規劃及建置。
四、飛航資料之蒐集、統計及分析。
五、飛航服務系統技術資料之蒐集、研究及建議。
六、其他有關系統發展事項。