設計科掌理事項如下：
一、公路整建計畫之擬訂、管理及執行；計畫路線之先期勘察及方案擬訂。
二、公路整建工程之規劃、測量、設計；地質探查之審核、管制及考核。
三、公路整建工程環境影響評估案件之規劃、設計階段之審核、管制及考核。
四、其他有關設計事項。