總工程司權責如下：
一、工程之策劃與工程計畫審定、設計及施工之督導。
二、工程設計圖說與工程技術規範及手冊之審定。
三、工程施政計畫之審議、督導及考核。
四、工程業務之協調及權責問題之核議。
五、綜理其他工程技術業務及交辦事項。