部門規劃科掌理事項如下：
一、人口、產業與土地使用政策之研究分析及推動建議。
二、住宅發展與城鄉建設政策、計畫之研議及相關工程規劃之推動。
三、地方跨域合作與跨部會政策計畫之研議及協調。
四、國家永續發展與花東永續發展策略之推動及協調。
五、其他有關部門規劃事項。