新設立且應先檢具水措計畫之事業，於未取得目的事業主管機關之相關證明文件前，由地方主管機關先核准水措計畫者，應於申請土壤處理許可證時，補齊相關證明文件。
新設立之事業因目的事業主管機關訂有設立許可、試車會勘及登記之制度，非以登記證明文件申請土壤處理許可證，由地方主管機關先核發土壤處理許可證者，應於取得該登記證明文件後三十日內，辦理變更。