發生跨直轄市、縣（市）之災害或緊急傷病患事故或有發生之虞時，中央衛生主管機關得於本系統建立災害事件檔，並通知相關地方衛生主管機關及區域緊急醫療應變中心。
相關地方衛生主管機關於接獲前項通知後，應通知所轄急救責任醫院將傷亡資料登錄於該事件檔，並於災害、事故狀況解除後，通報最後傷亡統計，辦理結案。