本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算；下設農業發展基金、漁業發展基金、農產品受進口損害救助基金、林務發展及造林基金、農業天然災害救助基金及農村再生基金六個基金，編製附屬單位預算之分預算，均以行政院農業委員會（以下簡稱農委會）為主管機關。