申請外國籍船員證者，應由漁業人填具申請書，並檢附下列文件，經由當地區漁會代為向中央主管機關委託之直轄市或縣（市）主管機關申請：一、最近二吋半身正面脫帽相片二張。
二、護照影本一份。
三、中央勞工主管機關招募許可文件影本一份。
四、中央衛生主管機關指定醫院出具檢查後之體格檢查表文件影本一份。
五、符合第十一條第一項規定適任職務之相關訓練證明文件。
僱用外國籍船員之漁業人，應於取得中央勞工主管機關許可聘僱文件後七日內，先將許可聘僱文件影本報請中央主管機關委託之直轄市或縣（市）主管機關備查；外國籍船員受僱期滿返國或因故遣返時，所屬漁會應將外國籍船員證收回繳交原核發機關。
外國籍船員證有效期間，最長不得超過中央勞工主管機關許可之聘僱期間。
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