主任秘書承長官之命，處理事務，其權責如下：
一、本署文稿之綜核及代判。
二、機密與重要文件之處理及分配。
三、各種重要會議之籌劃及參加。
四、署長、副署長不在署時署務之代理。
五、分層負責權責範圍內事項之決定。
六、職責上應隨時提請署長、副署長注意之事項。
七、署長、副署長交辦事項。