本局氣象科技研究中心職掌如左：
一、氣象科技之研究、發展、技術轉移等事項。
二、氣象科技研究計畫之規劃、執行、管理、協調、聯繫、評估等事項。
三、技術性氣象會議之規劃及執行事項。
四、延聘國內外科技顧問之協調、聯繫、執行等事項。
五、氣象科技文獻及期刊之編印及交換事項。
六、圖書之蒐集、典藏、管理等事項。
七、大陸交通研究組氣象小組有關業務之協調及聯繫事項。
八、人才培育業務之綜合規劃及執行事項。
九、其他交辦事項。