本館設下列組、室、分館：
一、圖書館事業發展組。
二、館藏發展及書目管理組。
三、知識服務組。
四、特藏文獻組。
五、數位知識系統組。
六、國際合作組。
七、秘書室。
八、人事室。
九、政風室。
十、主計室。
十一、南部分館。