主辦機關之權責如下：
一、委託經營計畫構想之審查，及陳報核定機關。
二、蒐整相關商情資訊，舉行公開說明會。
三、委託經營執行計畫書之擬訂，及陳報核定機關。
四、大量解僱勞工時，解僱計畫書之擬訂、陳報核定機關核定、通知、公告及協商。
五、民間機構執行委託經營成效之監督考核。
六、委託經營契約所定權利義務之行使及履行。
七、辦理其他相關事項。