本辦法依財團法人法（以下簡稱本法）第二十五條第七項規定訂定之。
本辦法所稱電子傳輸，指全國性衛生財團法人（以下簡稱衛生財團法人）及醫療財團法人將文件、資料上網登錄、傳遞至衛生福利部（以下簡稱本部）設置之網站。
自本部公告之日起，衛生財團法人及醫療財團法人應於每年年度開始後一個月內，將當年度經董事會通過之工作計畫及經費預算相關文件、資料，以電子傳輸方式，報本部備查。
工作計畫及經費預算，與洗錢或資恐高風險國家或地區有關者，其風險評估報告，依前項規定辦理。
衛生財團法人及醫療財團法人應於每年結束後五個月內，將前一年度經董事會通過之工作報告及財務報表相關文件、資料，以電子傳輸方式，報本部備查。
置有監察人之衛生財團法人及醫療財團法人，其監察人依本法第二十五條第二項製作之前一年度監察報告書，併同前項工作報告及財務報表，以電子傳輸方式，報本部備查。
衛生財團法人及醫療財團法人之財務報表，依本法第二十四條第二項及第三項規定，經本部公告應經會計師查核簽證者，本部得命該等衛生財團法人及醫療財團法人，將本法第二十五條第三項所定應主動公開之全部或一部資訊，以電子傳輸方式，上傳至網站公開之。
電子傳輸之流程如下：一、依本部提供之帳號、密碼及其他相關資安防護措施登入。
二、登錄及傳輸董事會通過第三條、第四條所定資料之會議紀錄。
三、登錄及傳輸第三條、第四條所定前款以外文件、資料。
四、確認送出。
前項電子傳輸之格式，以本部於網站公告者為限。
衛生財團法人及醫療財團法人於前條網站登錄及傳輸之文件、資料，不得有虛偽不實或隱匿之情事。
第三條及第四條所定備查之文件、資料，除其他法令另有規定外，應保存七年。