本辦法依祭祀公業條例（以下簡稱本條例）第五十四條第五項規定訂定之。
祭祀公業土地清理獎金依本條例第五十四條第二項規定，由直轄市或縣（市）主管機關代為標售土地價金千分之五支應。
祭祀公業土地清理獎金之分配，以依本條例辦理祭祀公業土地清理工作之直轄市或縣（市）、鄉（鎮、市、區）主管機關主辦單位、登記機關及其他協助機關（單位）之在事人員為對象。
祭祀公業土地清理獎金之分配比例及核算，由直轄市或縣（市）主管機關邀集地政、民政、戶政、稅捐及其他協助祭祀公業土地清理工作之機關（單位）代表召開審查會議，依祭祀公業土地清理工作執行情形決定之。
前項會議應於依本條例規定代為標售土地後每六個月召開一次，直轄市或縣（市）主管機關並應於會後三十日內繕造受分配機關（單位）祭祀公業土地清理獎金核發比例清冊辦理核發事宜。
受分配機關（單位）於核發祭祀公業土地清理獎金予第三條人員時，應以執行祭祀公業土地清理工作之輕重為基準，並審酌下列情狀為獎金高低之參據：一、擔任祭祀公業土地清理之職務。
二、辦理祭祀公業土地清理之件數、筆數、面積。
三、辦理祭祀公業土地清理案件之複雜程度。
四、執行祭祀公業土地清理實施計畫之進度。
五、執行祭祀公業土地清理之工作效率。
六、執行祭祀公業土地清理之負責態度。
祭祀公業土地清理獎金之分配及核發，直轄市或縣（市）主管機關應循預算程序辦理。
已登記建築改良物權利之清理，其獎金之分配及核發，準用本辦法規定辦理。