海軍技術學校（以下簡稱本校）隸屬國防部，得委任國防部海軍司令部辦理。
本校設下列各處、室、中心，分別掌理下列事項：一、教務處：掌理招生、註冊、課務、教材、學籍及其他教務等事項。
二、學員生事務處：掌理心理輔導、生活輔導、衛生保健、課外活動指導、愛國教育、輔導服務、軍紀監察、軍事安全等事項。
三、總務處：掌理文書、人事、後勤、工程營建及其他總務事項。
四、資訊中心：掌理教學研究資料之蒐集與資訊之教學、研究、推廣及資訊服務之提供等事項。
五、主計室：掌理歲計、會計及統計事項。
本校因教學、研究及推廣之需要，得報請國防部核定，調整或設其他必要單位。
本校設航海事務部、戰鬥系統部、動力系統部、學員生大隊部、勤務連。
本校置校長一人，少將，綜理校務；教育長、政戰主任各一人，均為上校，襄助校長處理校務。
本校置副教育長、部主任、處長、組長、主任、大隊長、副處長、主任教官、教官、參謀、輔導長、中隊長、連長、副中隊長、排長。
本規程中華民國九十六年一月十九日修正施行後，不得進用一般聘雇人員；已進用者，得繼續僱用至離職為止。