第5條業務一組掌理事項如下：一、進口、轉運、轉口及郵遞貨物之通關。二、進口稅則預先審核及疑義案件之處理。三、進口貨物保稅、補稅、免稅、押款、退款、按月彙繳、分期繳納關稅、暫准通關案件及艙單之處理。四、進口報單審核、副本核發及貨物稅完（免）稅照之處理。五、進口貨物退運、調換、聲明放棄之處理。六、進出口貨物化驗、鑑定及貨樣管理。七、優質企業之認證、驗證及管理。八、運輸業登記、管理及自備封條申請案件之處理。九、違章及行政救濟案件之處理。十、其他有關進口貨物通關事項。