第4條本中心設下列組、室：一、綜合規劃組，分五科辦事。二、國稅組，分五科辦事。三、地方稅及徵課組，分五科辦事。四、資通營運組，分四科辦事。五、系統設計及資理組，分五科辦事。六、電子發票組，分四科辦事。七、秘書室。八、人事室。九、政風室。十、主計室。十一、支援服務室，分二科辦事。