本局設下列科、室、稽徵所及服務處：一、綜合規劃科，分二股辦事。
二、服務科，分二股辦事。
三、稅務資訊科，分五股辦事。
四、審查一科，分五股辦事。
五、審查二科，分四股辦事。
六、審查三科，分三股辦事。
七、審查四科，分三股辦事。
八、徵收科，分三股辦事。
九、法務一科，分四股辦事。
十、法務二科，分三股辦事。
十一、秘書室，分四股辦事。
十二、人事室，分三股辦事。
十三、政風室，分三股辦事。
十四、主計室，分四股辦事。
十五、監察室，分三股辦事。
十六、三重稽徵所，分六股辦事。
十七、新莊稽徵所，分六股辦事。
十八、中和稽徵所，分六股辦事。
十九、汐止稽徵所，分四股辦事。
二十、中壢稽徵所，分六股辦事。
二十一、新店稽徵所，分五股辦事。
二十二、淡水稽徵所，分四股辦事。
二十三、楊梅稽徵所，分四股辦事。
二十四、大溪稽徵所，分四股辦事。
二十五、竹東稽徵所，分四股辦事。
二十六、蘆竹稽徵所，分四股辦事。
二十七、信義稽徵所，分二股辦事。
二十八、羅東稽徵所，分四股辦事。
二十九、玉里稽徵所，分二股辦事。
三十、金門稽徵所，分二股辦事。
三十一、瑞芳服務處。
三十二、馬祖服務處。
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