重要濕地之評選，應就下列情形綜合評估後，依本法第八條各款所列事項，評定其等級：一、生物多樣性：（一）生態系完整程度，包括棲地、物種之重要性及多樣性、是否有外來入侵種。
（二）保育類物種及其關鍵性。
二、自然性、代表性及特殊性：（一）自然性：指該濕地自然化或人工化之程度，及未來以自然方式維持運作之能力。
（二）代表性：指該濕地於濕地類型中具代表意義。
（三）特殊性：指該濕地於科學研究、文化資產、生態與環境及其他等是否具備特殊意義。
三、規劃合理性：（一）申請濕地於國際、國家或地方生態廊道地位及替代可能性。
（二）申請濕地範圍是否兼顧保育目標及相關土地使用現況。
（三）申請濕地等級之合理性。
（四）申請濕地與相關計畫相容性，其後續經營管理之社會成本與保育價值是否具相當性及合理性。
四、土地所有權人意願：私有土地所有權人同意比率。
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