第29條有下列情形之一者，處新臺幣三百萬元以上一千五百萬元以下罰鍰，並得令其停止現場作業、運轉或限載運轉：一、違反第六條第一項、第二項規定裝填核子燃料或運轉。二、違反第十一條第一項規定，僱用未領有合格執照人員操作或無執照而擅自操作核子反應器。三、違反第十四條第一項規定而有危害公眾健康與安全或環境生態之虞，且情節重大、未於期限內改善或採行必要措施者。不遵行主管機關前項命令者，處三年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣三百萬元以下罰金。