第4條本署設下列組、室、區管理中心：一、企劃及科技管理組，分四科辦事。二、食品組，分六科辦事。三、藥品組，分六科辦事。四、醫療器材及化粧品組，分六科辦事。五、管制藥品組，分六科辦事。六、研究檢驗組，分六科辦事。七、品質監督管理組，分五科辦事。八、秘書室，分三科辦事。九、人事室，分二科辦事。十、政風室。十一、主計室，分二科辦事。十二、資訊室，分二科辦事。十三、北區管理中心，分六科辦事。十四、中區管理中心，分三科辦事。十五、南區管理中心，分三科辦事。