第39條執行科掌理左列事項:一、關於刑事執行案件之編號及分配。二、關於刑事執行案卷及文件之點收、登記、保管。三、關於筆錄、傳票、拘票、提票、押票、釋票、執行指揮書及其他文書之製作。四、關於刑事執行及觀護業務文稿之撰擬。五、關於刑事執行案卷之整理、編訂、發送、歸檔。六、關於刑事執行案件各項表報之製作或統計等資料之提供。七、關於保證金及贓證物品之處理。八、關於保護管束事務之處理。九、其他應由執行書記官辦理或長官交辦事項。