第5條本部之次級機關及其業務如下：一、國庫署：規劃、執行國庫及支付業務。二、賦稅署：規劃、執行全國賦稅業務。三、各地區國稅局：執行各地區國稅稽徵業務。四、關務署：規劃、執行全國關務業務。五、國有財產署：規劃、執行國有財產管理業務。六、財政資訊中心：規劃、執行本部與所屬機關（構）資訊業務之推展及管理事項。