第11條以電腦系統處理與國家機密有關之資訊，應加密處理，其方式如下：一、軍事檢察官或軍事審判官製作訴訟書類及軍法書記官製作正本時，應以單機作業並以光碟片加密儲存。二、前款書類電子檔應俟國家機密解密後，將檔案解密並上傳軍法裁判及檢察書類檢索系統。